بالاول من ايار لعام 2001 اعتقل القائد وائل الجاغوب إثر تنفيذ عملية عسكرية ضد الاحتلال ورفاق دربه قرب نابلس ليزج بالسجن ويصدر حكمًا بحقه بالسجن مدى الحياه تضاف إلى سنوات ست قد قُضيت من عمره بالسجون حيث كان قد اعتقل عام 1992 وحكم 6 أعوام.
 الاسير القائد "وائل الجاغوب" هو مسؤول منظمة الجبهة الشعبية - فرع السجون، ويعتبر من قيادات الحركة الاسيرة ومن مفجري الإضراب عن الطعام والتصدي لإدارة مصلحة السجون، وقد مورست بحق الاسير وائل عقوبات عديدة أهمها العزل والنقل المفاجىء من سجن لآخر حيث نقل بالسنوات الأخيرة 6 مرات ما بين سجن ريمون ونفحة وجلبوع وذلك ضمن سياسة ممنهجة لخلق حالة من عدم التواصل بحق قيادة الحركة الأسيرة، وقد التقى الاسير وائل بشقيقه محمد عام 2007 بسجن جلبوع وسُمح لوالدته بزيارته بعد أربع سنوات من اعتقاله.
والأسير وائل الجاغوب يعتبر من مفكري الحركة الأسيرة وأصدر العديد من الكتب والروايات منها رواية بعنوان "أحلام"، ورواية بعنوان "أحلام مؤجلة"، وكتاب "رسائل في التجربة الاعتقالية".